Ứng dụng kỹ thuật real-time pcr và reverse Dot-Blot xác định type HPV có nguy cơ gây ung thư cổ tử cung

99
Tạp chí Y Dược học - Trường Đại học Y Dược Huế - Tập 7, số 3 - tháng 6/2017
JOURNAL OF MEDICINE AND PHARMACY
ỨNG DỤNG KỸ THUẬT REAL-TIME PCR VÀ REVERSE DOT-BLOT 
XÁC ĐỊNH TYPE HPV CÓ NGUY CƠ GÂY UNG THƯ CỔ TỬ CUNG
Phan Văn Bảo Thắng1, Nguyễn Hoàng Bách1, Nguyễn Văn Thành2, 
Trần Thị Như Hoa1, Ngô Viết Quỳnh Trâm1
(1) Trường Đại học Y Dược Huế
 (2) Trường Trung học Quốc học Huế 
Tóm tắt
Đặt vấn đề: Nhiễm trùng HPV là nguyên nhân chính gây ung thư cổ tử cung (UTCTC). Phát hiện HPV và xác 
định type HPV giúp chẩn đoán, điều trị hợp lý và tiên lượng các trường hợp viêm/UTCTC. Mục tiêu: Xác định 
tỷ lệ các type HPV có nguy cơ gây UTCTC và các loại hình nhiễm type HPV. Phương pháp: 177 mẫu dịch cổ tử 
cung được lấy từ bệnh nhân được chẩn đoán viêm hoặc có bất thường ở kết quả phết tế bào cổ tử cung tại 
Bệnh viện Trường Đại học Y Dược. Thực hiện kỹ thuật real-time PCR phát hiện nhiễm HPV và kỹ thuật reverse 
Dot-Blot xác định genotype HPV từ những mẫu PCR dương tính. Kết quả: 7 type HPV nguy cơ cao được xác 
định, thường gặp nhất là type 18 (74,6%) và type 16 (37,6%). Loại hình đơn nhiễm chiếm 30,4% và đa nhiễm 
chiếm tỷ lệ cao hơn (69,6%), trong đó đồng nhiễm 2 và 3 type HPV thường gặp nhất (32,2% và 20,3%). Kết 
luận: Phối hợp kỹ thuật real-time PCR và reverse Dot-Blot cho phép xác định type HPV nguy cơ cao gây UTCTC 
và các loại hình nhiễm HPV.
Từ khoá: reverse DOT-BLOT, real-time PCR, PCR, ung thư cổ tử cung, type HPV 
Abstract
APPLICATION OF REAL-TIME PCR TECHNIQUE AND REVERSE 
DOT-BLOT FOR DETECTION THE HIGH RISK TYPES OF HUMAN 
PAPILLOMAVIRUS CAUSING CERVICAL CANCER 
Phan Van Bao Thang1, Nguyen Hoang Bach1, Nguyen Van Thanh2, 
Tran Thi Nhu Hoa1, Ngo Viet Quynh Tram1
(1) Hue University of Mediicine and Pharmacy
(2) Quoc Hoc High School, Hue City
Introduction: Infection with HPV is the main cause of cervical cancer. Determining HPV infection and 
the types of HPV plays an important role in diagnosis, treatment and prognosis of cervicitis/cervical cancer. 
Aims: Determining proportion of high-risk HPV types and the occurrence of coinfection with multiple HPV 
types. Methods: 177 women with cervicitis or abnormal Pap smear result were enrolled in the study. 
Performing the real-time PCR for detecting HPV and the reverse DOT-BLOT assay for determining type of HPV 
in cases of positive PCR. Results: 7 types of high-risk HPV was dectected, the majority of these types were 
HPV type 18 (74.6%) and HPV type 16 (37.6%); the proportion of infection with only one type of HPV was 
30.4% and coinfection with multiple HPV types was higher (69.6%), the coinfected cases with 2 and 3 types 
were dominated (32.2% and 20.3%, respectively) and the coinfected cases with 4 and 5 types were rare. 
Conclusion: Use of the real-time PCR and reverse DOT-BLOT assay can determine the high-risk HPV types and 
the occurrence of coinfection with multiple HPV types.
Key words: HPV type, Reverse DOT-BLOT, real-time PCR,PCR, cervical cancer
1. ĐẶT VẤN ĐỀ
HPV là tác nhân virus gây nhiễm trùng đường 
sinh dục thường gặp nhất. HPV được xác định là 
nguyên nhân gây ung thư cổ tử cung (UTCTC) và 
các tiền thương tổn của chúng. Dựa vào kiểu gen, 
HPV được chia thành hai nhóm nguy cơ gây UTCTC: 
nhóm HPV có nguy cơ cao và nhóm HPV có nguy 
cơ thấp, nhiễm HPV type có nguy cơ cao là nguyên 
nhân chủ yếu đẫn đến ung thư cổ tử cung, trong 
số hơn 200 type HPV khác nhau đã được xác định, 
- Địa chỉ liên hệ: Ngô Viết Quỳnh Trâm, email: qtramnv@gmail.com
- Ngày nhận bài: 20/5/2017; Ngày đồng ý đăng: 12/6/2017; Ngày xuất bản: 18/7/2017
100
Tạp chí Y Dược học - Trường Đại học Y Dược Huế - Tập 7, số 3 - tháng 6/2017
JOURNAL OF MEDICINE AND PHARMACY
các type có nguy cơ gây ung thư cao phổ biến là 16, 
18, 33, 45, 56 và 58 [1]currently consisting of 79 
fully characterized human PV (HPV. Nghiên cứu của 
Ibeanu đã ước lượng tần suất nhiễm HPV trong các 
trường hợp UTCTC trên toàn thế giới lên đến 95% 
[2]. Tỷ lệ nhiễm HPV ở phụ nữ thành phố Hồ Chí 
Minh là 8,34% [3]. Tỉ lệ nhiễm ở trường hợp có tổn 
thương tế bào cổ tử cung từ ASCUS trở lên ở thành 
phố Hồ Chí Minh là 73,6% [4] và ở Huế là 55,4%. 
Phát hiện HPV và xác định type HPV giúp chẩn 
đoán, điều trị hợp lý và tiên lượng các trường hợp 
viêm/ung thư cổ tử cung. Hiện nay có nhiều phương 
pháp xác định genotype HPV như kỹ thuật real-time 
PCR đa mồi, PCR phối hợp với kỹ thuật lai DNA, giải 
trình tự gen (sequencing), Hybrid Capture II  Việc 
lựa chọn một phương pháp dễ thực hiện, rẻ tiền và 
có thể phát hiện được đồng thời nhiều type HPV có 
nguy cơ cao gây UTCTC có ý nghĩa quan trọng. Kỹ 
thuật Hybrid Capture II và PCR phối hợp kỹ thuật 
lai DNA được cho là kỹ thuật có độ nhạy cao tương 
đương [5]. Với những trang thiết bị về kỹ thuật sinh 
học phân tử sẵn có tại phòng thí nghiệm của bộ môn 
Vi sinh, chúng tôi thực hiện đề tài này bằng phối hợp 
kỹ thuật real-time PCR với kỹ thuật lai DNA nhằm hai 
mục tiêu sau:
- Xác định tỷ lệ các type HPV có nguy cơ gây ung 
thư cổ tử cung.
- Xác định các loại hình nhiễm type HPV.
2. ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN 
CỨU
2.1. Đối tượng nghiên cứu: 177 mẫu dịch cổ tử 
cung được lấy từ bệnh nhân được chẩn đoán viêm 
hoặc có bất thường ở kết quả phết tế bào cổ tử cung, 
tại khoa Sản, bệnh viện Trường Đại học Y Dược Huế. 
2.2. Phương pháp nghiên cứu: nghiên cứu mô 
tả cắt ngang.
2.3. Tiến hành
- Bệnh phẩm: dịch cổ tử cung được lấy ở phòng 
khám Sản phụ khoa bằng que tăm bông vô trùng, 
cho vào ống Eppendoft 1,5ml chứa 400µl đệm TE rồi 
chuyển đến phòng xét nghiệm Vi sinh, bảo quản ở 
-20oC cho đến khi thực hiện kỹ thuật.
- Tách chiết DNA: mẫu bệnh phẩm được tan 
đông ở nhiệt độ phòng, lắc trộn đều trên máy 
vortex BioRad, lấy 200µl và tách chiết DNA với bộ kít 
LightPoweriVApDNA Extraction Kit (Công ty Cổ phần 
Công nghệ Việt Á).
- Thực hiện kỹ thuật real-time PCR phát hiện HPV: 
lấy 5µl DNA đã tách chiết của mỗi mẫu bệnh phẩm 
cho vào dung dịch phản ứng của bộ kít LightPoweriVA 
HPV Genotype rPCR (Công ty Cổ phần Công nghệ 
Việt Á) để thực hiện kỹ thuật PCR theo nguyên lý 
dùng mẫu dò TaqMan đặc hiệu cho HPV như quy 
trình hướng dẫn, thực hiện trên máy real-time PCR 
Mx3000 (Stratagene, Hoa Kỳ).
- Thực hiện kỹ thuật reverse Dot-Blot xác định 
genotype HPV: sản phẩm PCR có kết quả dương 
tính với HPV được sử dụng để tiến hành kỹ thuật 
lai DNA với các đầu dò DNA đặc hiệu cho các kiểu 
gen HPV (được gắn sẵn trên màng lai ở các vị trí 
đánh dấu như hình bên) theo quy trình của bộ kít 
LightPoweriVA HPV Genotype PCR-RDB (Công ty Cổ 
phần Công nghệ Việt Á) để xác định kiểu gen. Với bộ 
kít này sẽ phát hiện được 16 kiểu gen HPV có nguy 
cơ cao: 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 
59, 66, 68, 81 và 8 kiểu gen HPVcó nguy cơ thấp: 6, 
11, 40, 42, 43, 44, 54, 79. Kết quả dương tính khi 
thấy có chấm xanh xuất hiện trên màng lai, tương 
ứng với vị trí nào là genotype đó (Hình 1)
Hình 1. Vị trí kiểu gen HPV tương ứng trên màng lai và kết quả dương tính với genotype 6
- Xử lý số liệu bằng phần mềm SPSS 16.0.
3. KẾT QUẢ
Thực hiện kỹ thuật real-time PCR phát hiện HPV cho 177 mẫu dịch cổ tử cung của bệnh nhân viêm 
hoặc loạn sản cổ tử cung và kỹ thuật reverse Dot-Blot xác định type HPV trên mẫu nghiệm PCR dương tính, 
chúng tôi có được kết quả như sau:
101
Tạp chí Y Dược học - Trường Đại học Y Dược Huế - Tập 7, số 3 - tháng 6/2017
JOURNAL OF MEDICINE AND PHARMACY
3.1. Tỷ lệ HPV dương tính được phát hiện bằng kỹ thuật PCR
 Bảng 1. Tỷ lệ HPV dương tính
HPV Số lượng (n) Tỷ lệ (%)
Dương tính 59 33,3
Âm tính 118 66,7
Tổng cộng 177 100,0
Trong 177 mẫu dịch cổ tử cung được làm PCR phát hiện nhiễm HPV, tỷ lệ dương tính là 33,3%.
3.2. Tỷ lệ các type HPV được xác định ở các mẫu PCR dương tính
Bằng kỹ thuật reverse DOT BLOT, chúng tôi đã xác định được 9 type HPV khác nhau trong số 59 mẫu PCR 
dương tính với HPV, gồm các loại hình đơn nhiễm và đa nhiễm, trong đó có 2 type HPV thuộc nhóm có nguy 
cơ gây UTCTC thấp và 7 type HPV thuộc nhóm có nguy cơ cao. Trong nhóm HPV có nguy cơ cao, type HPV hay 
gặp nhất là type 18 (74,6%) và type 16 (37,3%); type HPV 6 có nguy cơ thấp chiếm tỷ lệ cao thứ hai trong tất 
cả 9 type được xác định (66,1%) và type 11 chiếm tỷ lệ 23,7%. 
Bảng 2. Tỷ lệ các type HPV được xác định
Type HPV có nguy cơ
 gây UTCTC
Số lượng (n)
HPV dương tính (N = 59)
Tỷ lệ (%)
thấp
 6 39 66,1
11 14 23,7
cao
16 22 37,3
18 44 74,6
33 3 5,1
39 1 1,7
51 1 1,7
52 11 18,6
58 4 6,8
3.3. Sự phân bố các loại hình nhiễm HPV 
Bảng 3. Tỷ lệ các loại hình đơn nhiễm và đa nhiễm HPV
HPV Số lượng (n) Tỷ lệ (%)
Đơn nhiễm 18 30,5
Đa nhiễm 41 69,5
Tổng cộng 59 100,0
Trong số 59 mẫu HPV dương tính, có 18 mẫu (30,5%) chỉ nhiễm 1 type HPV và có đến 41 mẫu (69,5%) 
nhiễm đồng thời nhiều type HPV khác nhau.
Bảng 4. Tỷ lệ các type HPV theo loại hình đơn nhiễm và đa nhiễm
Nguy cơ gây UTCTC Type HPV
Đơn nhiễm (N=18) Đa nhiễm (N=41)
n1 % n2 %
thấp
6 5 27,8 34 82,9
11 3 16,7 11 26,8
cao
16 2 11,2 20 48,8
18 5 27,8 39 95,1
33 1 5,6 2 4,9
39 0 - 1 2,4
51 1 5,6 0 -
52 0 - 11 26,8
58 1 5,6 3 7,3
102
Tạp chí Y Dược học - Trường Đại học Y Dược Huế - Tập 7, số 3 - tháng 6/2017
JOURNAL OF MEDICINE AND PHARMACY
Trong loại hình đơn nhiễm HPV6 và type 18 chiếm tỷ lệ cao nhất (đều chiếm tỷ lệ 27,8%), các type HPV 
nguy cơ gây UTCTC chiếm 55,6%. Trong loại hình đa nhiễm HPV, hầu hết các trường hợp đều nhiễm type có 
nguy cơ là 18 (95,1%), tiếp đến là type 16 (48,8%). HPV6 có nguy cơ gây UTCTC thấp cũng là type hay gặp 
trong loại hình đa nhiễm (82,9%).
Bảng 5. Tỷ lệ các type HPV theo loại hình nhiễm HPV
Loại hình
nhiễm HPV
Đơn Hai Ba Bốn Năm Tổng cộng
n % n % n % n % n % n %
Nguy cơ thấp 8 13,6 1 1,7 0 - 0 - 0 - 9 15,2
Nguy cơ cao 10 16,9 5 8,5 1 1,7 0 - 0 - 16 27,1
Hỗn hợp - - 13 22,0 11 18,6 8 13,5 2 3,4 34 57,7
Tổng cộng 18 30,5 19 32,2 12 20,3 8 13,5 2 3,4 59 100,0
Hình 2. Kết quả reverse DOT BOT: loại hình đồng nhiễm 3 type (a), nhiễm 4 type (b)
và nhiễm 5 type (c) HPV tương ứng với vị trí các type HPV tương ứng trên màng lai (d)
Loại hình nhiễm chỉ một type HPV chiếm 30,4% 
trong số các trường hợp HPV dương tính, trong đó 
nhiễm type có nguy cơ cao là 16,9%. Đồng nhiễm hai 
và ba type HPV chiếm tỷ lệ lần lượt là 32,2% và 20,3%, 
có đến 8 trường hợp (13,5%) đồng nhiễm bốn type và 
2 trường hợp (3,4%) đồng nhiễm năm type. Hầu hết 
các loại hình đồng nhiễm đều có nhiễm các type HPV 
thuộc nhóm có nguy cơ cao, chỉ 1 trường hợp (1,7%) 
nhiễm đồng thời 2 type HPV nguy cơ thấp.
4. BÀN LUẬN
Nghiên cứu chúng tôi có 59 (33,3%) trường hợp 
dương tính với HPV, trong đó có 9 type HPV được 
phát hiện gồm 2 type thuộc nhóm có nguy cơ gây 
UTCTC thấp và 7 type thuộc nhóm có nguy cơ cao. 
Tỷ lệ nhiễm HPV trong nghiên cứu của Phạm Việt 
Thanh trên bệnh nhân có kết quả phết tế bào cổ tử 
cung bất thường là 62,1±0,49, nhiễm HPV16 chiếm 
tỷ lệ cao nhất 53,1%, HPV18 là 19,8% và HPV6 là 
28,7% [6]. Nghiên cứu của Vũ Thị Nhung (2006) trên 
đối tượng là phụ nữ thành phố Hồ Chí Minh cũng 
cho kết quả là HPV18 chiếm tỷ lệ cao nhất (52,23%), 
còn type 16 chiếm 13,34% [3]. Kết quả của Trương 
Quang Vinh tại Huế ở phụ nữ có thương tổn tiền 
ung thư và ung thư cổ tử cung cho thấy tỷ lệ nhiễm 
HPV là 55,4%, trong đó type 16 cao nhất (49,2%), 
tiếp theo là type 18 (19,0%) [7]. Kết quả của chúng 
tôi cho thấy HPV18 hay gặp nhất (74,6%), type 6 là 
66,1% và type 16 là 37,3%. Tỷ lệ nhiễm trùng HPV các 
type nguy cơ cao HPV16/HPV18 chiếm tỷ lệ 60-70% 
trong tất cả các nhiễm trùng HPV ở cơ quan sinh dục 
phụ nữ. Các nghiên cứu về HPV ở trong nước gần 
đây dùng real-time PCR xác định 14 type nguy cơ cao 
tìm thấy HPV16 chiếm ưu thế,tiếp đến là HPV18, tỷ 
lệ nhiễm đơn type chiếm trên 80% [5] [8] . Như vậy, 
chúng ta thấy sự phân bố các type HPV khác nhau 
phụ thuộc vào từng vùng địa lý, từng khu vực. 
Về loại hình nhiễm HPV, nghiên cứu chúng tôi 
có 30,4% trường hợp đơn nhiễm một type HPV, cao 
nhất là nhiễm hai 32,2%, nhiễm ba 20,3%, nhiễm 
bốn 13,5% và nhiễm năm là 3,4%. Trong các trường 
hợp đa nhiễm HPV, type 18 kết hợp với các kiểu gen 
khác chiếm tỷ lệ cao nhất (95,1%). Các type nguy cơ 
thấp HPV6 và HPV11 chỉ được phát hiện ở một số 
nghiên cứu khi dùng kỹ thuật PCR kết hợp với Dot 
Blot và tìm thấy với tỷ lệ thấp. Các nghiên cứu trên 
thế giới với số lượng lớn bệnh nhân có kiểm soát, 
tỷ lệ đơn nhiễm HPV chiếm >80%, tỷ lệ đa nhiễm 
chỉ chiếm 8-14% [9]but the risk associated with 
the various HPV types has not been adequately 
assessed. METHODS: We pooled data from 11 case-
control studies from nine countries involving 1918 
women with histologically confirmed squamous-cell 
cervical cancer and 1928 control women. A common 
103
Tạp chí Y Dược học - Trường Đại học Y Dược Huế - Tập 7, số 3 - tháng 6/2017
JOURNAL OF MEDICINE AND PHARMACY
protocol and questionnaire were used. Information 
on risk factors was obtained by personal interviews, 
and cervical cells were collected for detection of 
HPV DNA and typing in a central laboratory by 
polymerase-chain-reaction-based assays (with 
MY09/MY11 and GP5+/6+ primers.
Kết quả nghiên cứu của Trương Quang Vinh cho 
thấy tỷ lệ nhiễm HPV ở phụ nhứ có tổn thương tiền 
ung thư cà ung thư cổ tử cung với loại hình đơn type 
là 46,7% và đa type là 53,3% [7]. Nhiễm trùng HPV 
các nhóm có nguy cơ cao dai dẳng hoặc tái phát 
được xác định là nguyên nhân chính dẫn đến ung 
thư cổ tử cung [6]. Lee đã chỉ ra mối liên quan giữa 
nhiễm HPV và ung thư cổ tử cung là: nhiễm HPV một 
type duy nhất dẫn đến nguy cơ ung thư cổ tử 19,9 
lần và nhiễm nhiều type HPV sẽ làm tăng nguy cơ 
31,8 lần [10]. 
5. KẾT LUẬN
Phối hợp hai kỹ thuật real-time PCR và kỹ thuật 
reverse DOT BLOT chúng tôi xác định được hai type 
HPV nguy cơ cao gây UTCTC thường gặp là type 
18 (74,6%) và type 16 (37,6%); loại hình đa nhiễm 
chiếm tỷ lệ cao đến 69,5% trong đó đồng nhiễm 2 
và 3 type HPV thường gặp nhất (32,2% và 20,3%), 
có cả loại hình đồng nhiễm 4 và 5 type nhưng với tỷ 
lệ thấp. Đa số các trường hợp đồng nhiễm đều có 
nhiễm type 18 là type HPV nguy cơ cao.
TÀI LIỆU THAM KHẢO
1. Bolatti E.M., Chouhy D., Casal P.E., et al. (2016). 
Characterization of novel human papillomavirus types 
157, 158 and 205 from healthy skin and recombination 
analysis in genus γ-Papillomavirus. Infect Genet Evol, 42, 
20–29.
2. Ibeanu O. a (2011). Molecular pathogenesis of 
cervical cancer. Cancer Biol Ther, 11(3), 295–306.
3. Nhung V.T. (2006). Khảo sát tình hình nhiễm các 
týp HPV (Human Papilloma Virus) ở phụ nữ thành phố Hồ 
Chí Minh bằng kỹ thuật sinh học phân tử. Y học TP Hồ Chí 
Minh, 10(4), 402–407.
4. Nhung V.T. (2007). Liên quan giữa các type và các 
tổn thương tiền ung thư và ung thư cổ tử cung tại BV 
Hùng Vương. Kỷ yếu hội nghị Sản Phụ khoa Việt Pháp Châu 
Á Thái Bình Dương lần thứ VII.
5. Lê Quang Vinh, Đàm Thị Quỳnh Liên, Lưu Thị Hồng, 
Lê Hoài Chương, Lê Hoàng Linh, Nguyễn Thị Hồng Nga, 
Đào Duy Quân N.V.T. (2017). Tình Trạng Nhiễm HPV Nguy 
Cơ Cao ở Những Phụ Nữ Có Tổn Thương Tân Sản Nội Biểu 
Mô Và Ung Thư Cổ Tử Cung,. TC, 14(2).
6. Thanh P.V. (2011). Nghiên cứu tỉ lệ nhiễm Human 
Papillomavirus ở phụ nữ có phết tế bào cổ tử cung bất 
thường và các yếu tố liên quan. Y học TP Hồ Chí Minh, 
15(1), 158–165.
7. Vinh T.Q. and Thành C.N. (2010). Nghiên cứu nhiễm 
Human Papillomavirus ở phụ nữ có các tổn thương tiền 
ung thư và ung thư cổ tử cung. Y học thực hành, 718+719, 
229–240.
8. Yên P.T.T., Vinh L.Q., Dương N.K., et al. (2016). Tỷ Lệ 
Nhiễm Human Papilloma Virus ở Phụ Nữ Đến Khám Tại 
Bệnh Viện Phụ Sản Trung Ương. TC Phụ sản, 14(1).
9. Muñoz N., Bosch F.X., de Sanjosé S., et al. (2003). 
Epidemiologic classification of human papillomavirus 
types associated with cervical cancer. N Engl J Med, 
348(6), 518–27.
10. Lee S.A., Kang D., Seo S.S., et al. (2003). 
Multiple HPV infection in cervical cancer screened by 
HPVDNAChipTM. Cancer Lett, 198(2), 187–192.